Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Smim8Q9CQQ0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms