Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rwdd1Q9CQK7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rwdd1Q9CQK7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rwdd1Q9CQK7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rwdd1Q9CQK7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rwdd1Q9CQK7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rwdd1Q9CQK7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rwdd1Q9CQK7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rwdd1Q9CQK7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rwdd1Q9CQK7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rwdd1Q9CQK7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rwdd1Q9CQK7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rwdd1Q9CQK7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rwdd1Q9CQK7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rwdd1Q9CQK7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rwdd1Q9CQK7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rwdd1Q9CQK7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rwdd1Q9CQK7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rwdd1Q9CQK7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rwdd1Q9CQK7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rwdd1Q9CQK7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rwdd1Q9CQK7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rwdd1Q9CQK7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rwdd1Q9CQK7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rwdd1Q9CQK7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rwdd1Q9CQK7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rwdd1Q9CQK7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rwdd1Q9CQK7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rwdd1Q9CQK7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rwdd1Q9CQK7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rwdd1Q9CQK7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rwdd1Q9CQK7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rwdd1Q9CQK7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rwdd1Q9CQK7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rwdd1Q9CQK7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rwdd1Q9CQK7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rwdd1Q9CQK7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rwdd1Q9CQK7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rwdd1Q9CQK7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rwdd1Q9CQK7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rwdd1Q9CQK7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rwdd1Q9CQK7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rwdd1Q9CQK7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rwdd1Q9CQK7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rwdd1Q9CQK7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rwdd1Q9CQK7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rwdd1Q9CQK7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rwdd1Q9CQK7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rwdd1Q9CQK7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rwdd1Q9CQK7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rwdd1Q9CQK7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rwdd1Q9CQK7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rwdd1Q9CQK7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rwdd1Q9CQK7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rwdd1Q9CQK7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rwdd1Q9CQK7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rwdd1Q9CQK7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rwdd1Q9CQK7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rwdd1Q9CQK7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rwdd1Q9CQK7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rwdd1Q9CQK7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rwdd1Q9CQK7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rwdd1Q9CQK7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rwdd1Q9CQK7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms