Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ4

Rnf2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf2Q9CQJ4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf2Q9CQJ4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnf2Q9CQJ4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms