Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE6

Asf1a, Histone chaperone ASF1A, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1aQ9CQE6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Asf1aQ9CQE6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Asf1aQ9CQE6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Asf1aQ9CQE6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms