Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkp2Q9CQ73 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkp2Q9CQ73 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkp2Q9CQ73 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms