Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700029P11RikQ9CQ68 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
1700029P11RikQ9CQ68 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700029P11RikQ9CQ68 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms