Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ46

Efcab2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab2Q9CQ46 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Efcab2Q9CQ46 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Efcab2Q9CQ46 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Efcab2Q9CQ46 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Efcab2Q9CQ46 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Efcab2Q9CQ46 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Efcab2Q9CQ46 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Efcab2Q9CQ46 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Efcab2Q9CQ46 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Efcab2Q9CQ46 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Efcab2Q9CQ46 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Efcab2Q9CQ46 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Efcab2Q9CQ46 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Efcab2Q9CQ46 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Efcab2Q9CQ46 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Efcab2Q9CQ46 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Efcab2Q9CQ46 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Efcab2Q9CQ46 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Efcab2Q9CQ46 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Efcab2Q9CQ46 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Efcab2Q9CQ46 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Efcab2Q9CQ46 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Efcab2Q9CQ46 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Efcab2Q9CQ46 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Efcab2Q9CQ46 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Efcab2Q9CQ46 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Efcab2Q9CQ46 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Efcab2Q9CQ46 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Efcab2Q9CQ46 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Efcab2Q9CQ46 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Efcab2Q9CQ46 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Efcab2Q9CQ46 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Efcab2Q9CQ46 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Efcab2Q9CQ46 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Efcab2Q9CQ46 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Efcab2Q9CQ46 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Efcab2Q9CQ46 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Efcab2Q9CQ46 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Efcab2Q9CQ46 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Efcab2Q9CQ46 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Efcab2Q9CQ46 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Efcab2Q9CQ46 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Efcab2Q9CQ46 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Efcab2Q9CQ46 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Efcab2Q9CQ46 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Efcab2Q9CQ46 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Efcab2Q9CQ46 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Efcab2Q9CQ46 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Efcab2Q9CQ46 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Efcab2Q9CQ46 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Efcab2Q9CQ46 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms