Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pole4Q9CQ36 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pole4Q9CQ36 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms