Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Chmp3Q9CQ10 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp3Q9CQ10 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp3Q9CQ10 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
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