Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS7

Pno1, RNA-binding protein PNO1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pno1Q9CPS7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pno1Q9CPS7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pno1Q9CPS7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pno1Q9CPS7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pno1Q9CPS7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pno1Q9CPS7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pno1Q9CPS7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pno1Q9CPS7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pno1Q9CPS7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pno1Q9CPS7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pno1Q9CPS7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pno1Q9CPS7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pno1Q9CPS7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pno1Q9CPS7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pno1Q9CPS7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pno1Q9CPS7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pno1Q9CPS7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pno1Q9CPS7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pno1Q9CPS7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pno1Q9CPS7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pno1Q9CPS7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pno1Q9CPS7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pno1Q9CPS7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pno1Q9CPS7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pno1Q9CPS7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pno1Q9CPS7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pno1Q9CPS7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pno1Q9CPS7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pno1Q9CPS7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pno1Q9CPS7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pno1Q9CPS7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pno1Q9CPS7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pno1Q9CPS7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms