Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Bcl11bQ99PV8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Bcl11bQ99PV8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms