Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trim12aQ99PQ1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trim12aQ99PQ1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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