Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim26Q99PN3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim26Q99PN3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms