Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf2a1Q99PM3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2a1Q99PM3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms