Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nup155Q99P88 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nup155Q99P88 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nup155Q99P88 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nup155Q99P88 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nup155Q99P88 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nup155Q99P88 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nup155Q99P88 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nup155Q99P88 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nup155Q99P88 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nup155Q99P88 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nup155Q99P88 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nup155Q99P88 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nup155Q99P88 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nup155Q99P88 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nup155Q99P88 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nup155Q99P88 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nup155Q99P88 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nup155Q99P88 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nup155Q99P88 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nup155Q99P88 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Nup155Q99P88 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Nup155Q99P88 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Nup155Q99P88 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nup155Q99P88 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nup155Q99P88 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nup155Q99P88 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nup155Q99P88 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nup155Q99P88 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nup155Q99P88 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nup155Q99P88 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Nup155Q99P88 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Nup155Q99P88 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Nup155Q99P88 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nup155Q99P88 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms