Protein–RNA interactions for Protein: Q99P81

Abcg3, ATP-binding cassette sub-family G member 3, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg3Q99P81 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcg3Q99P81 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcg3Q99P81 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms