Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Rtn4Q99P72 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rtn4Q99P72 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rtn4Q99P72 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms