Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab27bQ99P58 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms