Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cep41Q99NF3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cep41Q99NF3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms