Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NsmfQ99NF2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NsmfQ99NF2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NsmfQ99NF2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms