Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bco2Q99NF1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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