Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BrapQ99MP8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BrapQ99MP8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BrapQ99MP8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms