Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nkd1Q99MH6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms