Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atp1b4Q99ME6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms