Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Gdpd3Q99LY2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdpd3Q99LY2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gdpd3Q99LY2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms