Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Chmp1b1Q99LU0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chmp1b1Q99LU0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chmp1b1Q99LU0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms