Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nmd3Q99L48 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nmd3Q99L48 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms