Protein–RNA interactions for Protein: Q99L43

Cds2, Phosphatidate cytidylyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds2Q99L43 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cds2Q99L43 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cds2Q99L43 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms