Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lactb2Q99KR3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lactb2Q99KR3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms