Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Reep3Q99KK1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Reep3Q99KK1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms