Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ufsp2Q99K23 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ufsp2Q99K23 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms