Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TrabdQ99JY4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TrabdQ99JY4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
TrabdQ99JY4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TrabdQ99JY4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TrabdQ99JY4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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