Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GatbQ99JT1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GatbQ99JT1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms