Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Atg5Q99J83 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg5Q99J83 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms