Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ddb2Q99J79 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms