Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apobec3Q99J72 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apobec3Q99J72 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apobec3Q99J72 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms