Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PdgfdQ925I7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PdgfdQ925I7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PdgfdQ925I7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PdgfdQ925I7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PdgfdQ925I7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PdgfdQ925I7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PdgfdQ925I7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PdgfdQ925I7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PdgfdQ925I7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PdgfdQ925I7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PdgfdQ925I7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PdgfdQ925I7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PdgfdQ925I7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PdgfdQ925I7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PdgfdQ925I7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PdgfdQ925I7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PdgfdQ925I7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PdgfdQ925I7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PdgfdQ925I7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PdgfdQ925I7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms