Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Chrna2Q91X60 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chrna2Q91X60 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms