Protein–RNA interactions for Protein: Q91WS2

Nlrp6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp6Q91WS2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nlrp6Q91WS2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Nlrp6Q91WS2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nlrp6Q91WS2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nlrp6Q91WS2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nlrp6Q91WS2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nlrp6Q91WS2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nlrp6Q91WS2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nlrp6Q91WS2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nlrp6Q91WS2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nlrp6Q91WS2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nlrp6Q91WS2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Nlrp6Q91WS2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Nlrp6Q91WS2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nlrp6Q91WS2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nlrp6Q91WS2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nlrp6Q91WS2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nlrp6Q91WS2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nlrp6Q91WS2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nlrp6Q91WS2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nlrp6Q91WS2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nlrp6Q91WS2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nlrp6Q91WS2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nlrp6Q91WS2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nlrp6Q91WS2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nlrp6Q91WS2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nlrp6Q91WS2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nlrp6Q91WS2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nlrp6Q91WS2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nlrp6Q91WS2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nlrp6Q91WS2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nlrp6Q91WS2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nlrp6Q91WS2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nlrp6Q91WS2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nlrp6Q91WS2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nlrp6Q91WS2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nlrp6Q91WS2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nlrp6Q91WS2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nlrp6Q91WS2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nlrp6Q91WS2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nlrp6Q91WS2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nlrp6Q91WS2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nlrp6Q91WS2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nlrp6Q91WS2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nlrp6Q91WS2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nlrp6Q91WS2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nlrp6Q91WS2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nlrp6Q91WS2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nlrp6Q91WS2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nlrp6Q91WS2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Nlrp6Q91WS2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nlrp6Q91WS2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nlrp6Q91WS2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nlrp6Q91WS2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms