Protein–RNA interactions for Protein: Q91WB7

Ubtd1, Ubiquitin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubtd1Q91WB7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubtd1Q91WB7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubtd1Q91WB7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms