Protein–RNA interactions for Protein: Q91W27

Pth2, Tuberoinfundibular peptide of 39 residues, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pth2Q91W27 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pth2Q91W27 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pth2Q91W27 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms