Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tdrd3Q91W18 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tdrd3Q91W18 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tdrd3Q91W18 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms