Protein–RNA interactions for Protein: Q91VF6

Col26a1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col26a1Q91VF6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Col26a1Q91VF6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col26a1Q91VF6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col26a1Q91VF6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms