Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc115Q8VE99 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc115Q8VE99 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms