Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS3

Cbx7, Chromobox protein homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx7Q8VDS3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx7Q8VDS3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cbx7Q8VDS3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms