Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uhrf1Q8VDF2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uhrf1Q8VDF2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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