Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt25Q8VCW2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt25Q8VCW2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt25Q8VCW2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms