Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajc28Q8VCE1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnajc28Q8VCE1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnajc28Q8VCE1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnajc28Q8VCE1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnajc28Q8VCE1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnajc28Q8VCE1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnajc28Q8VCE1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnajc28Q8VCE1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnajc28Q8VCE1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnajc28Q8VCE1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnajc28Q8VCE1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnajc28Q8VCE1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnajc28Q8VCE1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnajc28Q8VCE1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnajc28Q8VCE1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnajc28Q8VCE1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnajc28Q8VCE1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnajc28Q8VCE1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnajc28Q8VCE1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnajc28Q8VCE1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnajc28Q8VCE1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnajc28Q8VCE1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnajc28Q8VCE1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnajc28Q8VCE1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnajc28Q8VCE1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnajc28Q8VCE1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnajc28Q8VCE1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnajc28Q8VCE1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnajc28Q8VCE1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnajc28Q8VCE1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnajc28Q8VCE1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnajc28Q8VCE1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms