Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm4cQ8VCD7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm4cQ8VCD7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm4cQ8VCD7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdm4cQ8VCD7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm4cQ8VCD7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm4cQ8VCD7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm4cQ8VCD7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm4cQ8VCD7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm4cQ8VCD7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm4cQ8VCD7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdm4cQ8VCD7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm4cQ8VCD7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm4cQ8VCD7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm4cQ8VCD7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm4cQ8VCD7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm4cQ8VCD7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm4cQ8VCD7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm4cQ8VCD7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm4cQ8VCD7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm4cQ8VCD7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdm4cQ8VCD7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm4cQ8VCD7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm4cQ8VCD7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm4cQ8VCD7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm4cQ8VCD7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm4cQ8VCD7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm4cQ8VCD7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm4cQ8VCD7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm4cQ8VCD7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm4cQ8VCD7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdm4cQ8VCD7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm4cQ8VCD7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm4cQ8VCD7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms