Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

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Length 918 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rapgef3Q8VCC8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rapgef3Q8VCC8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rapgef3Q8VCC8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Rapgef3Q8VCC8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rapgef3Q8VCC8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rapgef3Q8VCC8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rapgef3Q8VCC8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rapgef3Q8VCC8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rapgef3Q8VCC8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rapgef3Q8VCC8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rapgef3Q8VCC8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rapgef3Q8VCC8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rapgef3Q8VCC8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
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